Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L1Q9NU39 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms