Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms