Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL1Q9NSC2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms