Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms