Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSU72Q9NP77 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSU72Q9NP77 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSU72Q9NP77 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSU72Q9NP77 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms