Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms