Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms