Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms