Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms