Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPERQ9BY12 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms