Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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