Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms