Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms