Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms