Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms