Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms