Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms