Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf72Q96LT7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms