Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTERF3Q96E29 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms