Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP4CQ96CF2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP4CQ96CF2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms