Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-328ENST00000628374 766 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-343ENST00000629339 870 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-326ENST00000628308 996 ntTSL 59.62□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-239ENST00000457076 542 ntTSL 49.41□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 TBCK-220ENST00000515705 592 ntTSL 59.27□□□□□ -0.932e-20■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-285ENST00000625864 744 ntTSL 58.8□□□□□ -11e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-365ENST00000630746 932 ntTSL 58.74□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-272ENST00000625215 844 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-314ENST00000627398 922 ntTSL 58.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-357ENST00000630214 1333 ntTSL 58.08□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-297ENST00000626609 809 ntTSL 58.08□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-337ENST00000629084 761 ntTSL 57.62□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-327ENST00000628322 694 ntTSL 57.62□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-276ENST00000625447 923 ntTSL 57.55□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-334ENST00000628837 866 ntTSL 57.55□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-330ENST00000628551 813 ntTSL 57.5□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-303ENST00000626842 741 ntTSL 57.49□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-298ENST00000626632 708 ntTSL 57.16□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-204ENST00000413436 602 ntTSL 46.88□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-363ENST00000630522 927 ntTSL 56.78□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-369ENST00000631107 840 ntTSL 56.62□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-332ENST00000628667 745 ntTSL 56.12□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-370ENST00000631110 851 ntTSL 56.03□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-311ENST00000627189 740 ntTSL 55.95□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-325ENST00000628305 1063 ntTSL 55.65□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-358ENST00000630280 566 ntTSL 55.64□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-312ENST00000627325 673 ntTSL 55.64□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-331ENST00000628659 922 ntTSL 55.24□□□□□ -1.571e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-279ENST00000625625 1025 ntTSL 55.24□□□□□ -1.571e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 TBCK-219ENST00000514689 703 ntTSL 35.18□□□□□ -1.582e-20■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-366ENST00000630759 891 ntTSL 55.13□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-294ENST00000626515 1041 ntTSL 54.97□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-277ENST00000625490 666 ntTSL 54.97□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-213ENST00000418564 547 ntTSL 54.3□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-207ENST00000415222 502 ntTSL 44.19□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.761e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-368ENST00000630985 594 ntTSL 53.96□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-361ENST00000630457 635 ntTSL 53.29□□□□□ -1.881e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.891e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PCBP1-AS1-346ENST00000629415 723 ntTSL 52.45□□□□□ -2.021e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 32
TBRG4Q969Z0 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 221.77■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 31.9
TBRG4Q969Z0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 31.9
TBRG4Q969Z0 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 31.9
TBRG4Q969Z0 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.155e-30■■■■■ 31.9
TBRG4Q969Z0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 31.9
TBRG4Q969Z0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 31.9
TBRG4Q969Z0 MGST2-203ENST00000503816 1780 ntTSL 516.56■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.8□□□□□ -13e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 MGST2-206ENST00000515137 1013 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 MGST2-205ENST00000515067 437 ntTSL 35.53□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 519.94■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 511.33□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 31.8
TBRG4Q969Z0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 413.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 24.69□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 220.12■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 219.62■□□□□ 0.735e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.735e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 218.2■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 211.82□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 26.28□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 31.7
TBRG4Q969Z0 TNS1-203ENST00000413280 667 ntTSL 49.15□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 31.5
TBRG4Q969Z0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 31.5
TBRG4Q969Z0 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 31.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D14-209ENST00000467966 627 ntTSL 313.31□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AC097382.1-201ENST00000441093 591 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.6□□□□□ -1.518e-7■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 26.39□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.142e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.191e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.051e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.841e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 226.39■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 526.15■■□□□ 1.781e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TJP1-210ENST00000558447 720 ntTSL 325.61■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.551e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ADD1-215ENST00000510101 704 ntTSL 324.49■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 31.4
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 144.2 ms