Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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PTPRUQ92729 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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