Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms