Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms