Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL11Q8NHH1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL11Q8NHH1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms