Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms