Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms