Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms