Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC28Q86X40 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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