Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTE2Q6XPS3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms