Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms