Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q6Q795 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Q6Q795 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q6Q795 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Q6Q795 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q6Q795 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q6Q795 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q6Q795 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q6Q795 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Q6Q795 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Q6Q795 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q6Q795 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Q6Q795 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Q6Q795 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Q6Q795 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Q6Q795 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Q6Q795 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Q6Q795 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Q6Q795 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Q6Q795 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Q6Q795 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q6Q795 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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