Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6P435 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6P435 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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