Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms