Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL2Q6F5E8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms