Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms