Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms