Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMPD1Q5SYB0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms