Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms