Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms