Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNRD1Q16881 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms