Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPP1R3AQ16821 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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