Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC18A3Q16572 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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