Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms