Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms