Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SS18Q15532 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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