Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIV2LQ15477 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms