Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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