Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms