Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKD1Q15139 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms